RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 OLAHQ9NV23 265 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ASPDHA6ND91 283 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 IQCF5A8MTL0 148 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 INPP4BO15327 924 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 KLK8O60259 260 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 OR4F21O95013 312 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 COL6A1P12109 1028 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 FASP25445 335 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TM4SF4P48230 202 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CYP51A1Q16850 503 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 XKR7Q5GH72 579 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 HECTD3Q5T447 861 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 H3BNH8 94 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GSK3BP49841 420 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TWF1Q12792 350 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 SUN2Q9UH99 717 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 H3BSA7 217 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 E2F3O00716 465 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 F11P03951 625 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NCK1P16333 377 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 LIPEQ05469 1076 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TRAF2Q12933 501 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 OR52B6Q8NGF0 335 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TSPEARQ8WU66 669 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TFAP2CQ92754 450 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ9Q92806 393 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 HIC2Q96JB3 615 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MYRFLQ96LU7 910 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.27■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 A0A1B0GVM2 712 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NBNO60934 754 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 STC2O76061 302 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 GALTP07902 379 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NAA20P61599 178 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ERVK-8P63133 956 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMEM74Q96NL1 305 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SNAP91O60641 907 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMCC1O94876 653 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZNF23P17027 643 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PSMA3P25788 255 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ARF5P84085 180 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TGFBIQ15582 683 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 OAZ3Q9UMX2 235 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PQY0 241 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 C1RP00736 705 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 GNAO1P09471 354 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 GRIK2Q13002 908 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMEM199Q8N511 208 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TTC16Q8NEE8 873 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PLD4Q96BZ4 506 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PIF1Q9H611 641 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SMOXQ9NWM0 555 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.25■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SELPP16109 830 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 OR1D2P34982 312 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 BORAQ6PGQ7 559 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.24■□□□□ 0.83
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