RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SCML2Q9UQR0 700 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 VWA7Q9Y334 891 aa4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.06□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF212BA8MTL3 300 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 A8MXQ7 604 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 RASA4O43374 803 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PHF2O75151 1096 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 STK17BO94768 372 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 CTSEP14091 401 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 GLRBP48167 497 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 EFEMP1Q12805 493 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT32Q14532 448 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNMB1Q16558 191 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 RNF220Q5VTB9 566 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 LINGO4Q6UY18 593 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 NMUR1Q9HB89 426 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SIX4Q9UIU6 781 aa4.05□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 TBL1XO60907 577 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CREG1O75629 220 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KLHL18O94889 574 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 HEXAP06865 529 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 STSP08842 583 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM163BP0C2L3 166 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF18P17022 549 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 F8A1P23610 371 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 CASP14P31944 242 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MCM7P33993 719 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT2P35908 639 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 ETV4P43268 484 aa4.04□□□□□ -1.76
ECHDC1-211ENST00000460558 MEOX1P50221 254 aa4.04□□□□□ -1.76
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