RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A10Q9HAW8 530 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A8Q9HAW9 530 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ATRXP46100 2492 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 AGRPO00253 132 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CSF2RBP32927 897 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 GDF10P55107 478 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 HHEXQ03014 270 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CFHR1Q03591 330 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SQSTM1Q13501 440 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KCTD3Q9Y597 815 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0G2JNG1 304 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SLC2A4P14672 509 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SPARCL1Q14515 664 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KIR2DS5Q14953 304 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 INSCQ1MX18 579 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KCTD11Q693B1 232 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KCNE4Q8WWG9 221 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM159Q96B96 161 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SMOXQ9NWM0 555 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PISDQ9UG56 409 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf81A6NN90 581 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 METTL18O95568 372 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ITIH1P19827 911 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 GPLD1P80108 840 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 NFATC2Q13469 925 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ITGA9Q13797 1035 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 PARP6Q2NL67 630 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 BRSK1Q8TDC3 778 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SLC38A3Q99624 504 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 CMKLR1Q99788 373 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ARNT2Q9HBZ2 717 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 OR5K4A6NMS3 321 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 JMJD7P0C870 316 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 LIMK2P53671 638 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 LDLRAP1Q5SW96 308 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 RCBTB1Q8NDN9 531 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 OR4D9Q8NGE8 314 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 PRORYQ9H606 182 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM9Q9P0T7 183 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 CPNE7Q9UBL6 633 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 PRAMEF1O95521 474 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SLC5A2P31639 672 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ETV5P41161 510 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 GTF2H3Q13889 308 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF398Q8TD17 642 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 TTC25Q96NG3 672 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 DPH1Q9BZG8 443 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 THRAP10827 490 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 MPSTP25325 297 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 CTSCP53634 463 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 JAMLQ86YT9 394 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 OR10G6Q8NH81 332 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 RTP4Q96DX8 246 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 KLK10O43240 276 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 DUX1O43812 170 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 CRTAMO95727 393 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC175P0C221 793 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms