RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXO39Q8N4B4 442 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RCBTB1Q8NDN9 531 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF398Q8TD17 642 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM74Q96NL1 305 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A087WV48 116 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC78A2IDD5 438 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 VEGFDO43915 354 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEF1O95521 474 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 IFNB1P01574 187 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ITIH1P19827 911 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CSF2RBP32927 897 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ETV5P41161 510 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 MAPK9P45984 424 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 HHEXQ03014 270 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GTF2H3Q13889 308 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PIM3Q86V86 326 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 BRSK1Q8TDC3 778 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC46A1Q96NT5 459 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC38A3Q99624 504 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 STRADBQ9C0K7 418 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PISDQ9UG56 409 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LOXL2Q9Y4K0 774 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2AG2A6NM03 316 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PLD2O14939 933 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 DXOO77932 396 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CPNE6O95741 557 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 F3P13726 295 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CCKBRP32239 447 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CXCR5P32302 372 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 XIAPP98170 497 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SEPT6Q14141 434 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM220Q6QAJ8 160 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LSMEM2Q8N112 164 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC25Q96NG3 672 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TLR10Q9BXR5 811 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYND15Q9H091 742 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ASB8Q9H765 288 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PDZK1P1A8MUH7 402 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PRSS56P0CW18 603 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR3P46089 330 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 FASLGP48023 281 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 POU6F1Q14863 301 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LDLRAP1Q5SW96 308 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 JAMLQ86YT9 394 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TIMM29Q9BSF4 260 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC40Q9H9A6 602 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ARNT2Q9HBZ2 717 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM8A1Q9UBU6 413 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR89AB7ZAQ6 455 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LDB2O43679 373 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CRTAMO95727 393 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 AP2A1O95782 977 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR89BP0CG08 455 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 BRAFP15056 766 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 AKT1P31749 480 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCG1P45844 678 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CLCNKAP51800 687 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGA9Q13797 1035 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SNAP47Q5SQN1 464 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RTP4Q96DX8 246 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SGF29Q96ES7 293 aa23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms