RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SLC4A1P02730 911 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM5P06731 702 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CES1P23141 567 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CXCR5P32302 372 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ACTR1BP42025 376 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ACTR1AP61163 376 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CTBSQ01459 385 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 GALNT3Q14435 633 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 IGFBP7Q16270 282 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CNGA3Q16281 694 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PPP2R5EQ16537 467 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TAZQ16635 292 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 BBS12Q6ZW61 710 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN33Q86UF1 283 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NAGSQ8N159 534 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ARRDC2Q8TBH0 407 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 DTD2Q96FN9 168 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 COQ10AQ96MF6 247 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SMIM14Q96QK8 99 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 OR2M4Q96R27 311 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SNX12Q9UMY4 172 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 APOC2P02655 101 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TCN2P20062 427 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 LHCGRP22888 699 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ADCY8P40145 1251 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ETV3P41162 512 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 GPR1P46091 355 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ARSDP51689 593 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 COPS2P61201 443 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MC2RQ01718 297 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 DPTQ07507 201 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MAP7Q14244 749 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 C4orf17Q53FE4 359 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 LRRC66Q68CR7 880 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ANKS6Q68DC2 871 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NRROSQ86YC3 692 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 GALNT13Q8IUC8 556 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ESX1Q8N693 406 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CNTD1Q8N815 330 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PIH1D2Q8WWB5 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 STARD8Q92502 1023 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ALG3Q92685 438 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 RTP4Q96DX8 246 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 UBP1Q9NZI7 540 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PDP2Q9P2J9 529 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CD84Q9UIB8 345 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YYE9 177 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ZNF185O15231 689 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PPM1DO15297 605 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 INPP4BO15327 924 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PMPCBO75439 489 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TRBC1P01850 177 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MMP2P08253 660 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PRKAR1AP10644 381 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PYGMP11217 842 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NFKB1P19838 968 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PTPN3P26045 913 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CSF2RBP32927 897 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 EPHA4P54764 986 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 IHHQ14623 411 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TEX44Q53QW1 395 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms