RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 ZBTB16Q05516 673 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 LRRC63Q05C16 580 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TAF5Q15542 800 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CST6Q15828 149 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 MPP7Q5T2T1 576 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PMF1Q6P1K2 205 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM270Q6UE05 265 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 RRAGAQ7L523 313 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TAC4Q86UU9 113 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CHSY1Q86X52 802 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 LGI2Q8N0V4 545 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF843Q8N446 348 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 IRGQQ8WZA9 623 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 GOLGA1Q92805 767 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 IGSF8Q969P0 613 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TTC17Q96AE7 1141 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SERAC1Q96JX3 654 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SERPINB11Q96P15 392 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 NT5C1BQ96P26 610 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TSG101Q99816 390 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 OMDQ99983 421 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TEX101Q9BY14 249 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 VPS11Q9H270 941 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SGK2Q9HBY8 427 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 RMND1Q9NWS8 449 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SARDHQ9UL12 918 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SDK2Q58EX2 2172 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.58□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 A0A1B0GTQ1 180 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 A0A1W2PR77 199 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 DRGXA6NNA5 263 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 K7ERQ8 282 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 VILLO15195 856 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC31A1O15431 190 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 IRAK2O43187 625 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 AKAP10O43572 662 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CD38P28907 300 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CHN2P52757 468 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ADPRHP54922 357 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CTXN1P60606 82 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 RAP2BP61225 183 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ST8SIA6P61647 398 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 NHLH2Q02577 135 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CDH18Q13634 790 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 CNGA2Q16280 664 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ACCSLQ4AC99 568 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 DCAF6Q58WW2 860 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 C9orf64Q5T6V5 341 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 KLHL10Q6JEL2 608 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P1-201ENST00000440184 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms