RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.1□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TWNKQ96RR1 684 aa11.1□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CD320Q9NPF0 282 aa11.1□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.1□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.1□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CLDN9O95484 217 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PRKAR1AP10644 381 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 COL6A1P12109 1028 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR1P46091 355 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ECT2LQ008S8 904 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CARTPTQ16568 116 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ESAMQ96AP7 390 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FPGTO14772 594 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TYROBPO43914 113 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PEX10O60683 326 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CHRNA4P43681 627 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 DUSP4Q13115 394 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TCEAL1Q15170 157 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TCAIMQ8N3R3 496 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SVOPLQ8N434 492 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 DPP7Q9UHL4 492 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PEAK1Q9H792 1746 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFRSF11BO00300 401 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NDUFS2O75306 463 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 RAET1GQ6H3X3 334 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM192Q8IY95 271 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FCRL5Q96RD9 977 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ING4Q9UNL4 249 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A088AWK7 358 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 AP3D1O14617 1153 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 AIREO43918 545 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TACR2P21452 398 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CLCNKBP51801 687 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 MTAPQ13126 283 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GTF2H2Q13888 395 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM110Q86TL2 294 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 HMCESQ96FZ2 354 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ACBD6Q9BR61 282 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SGK2Q9HBY8 427 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PIK3C2AO00443 1686 aa11.09□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SNED1Q8TER0 1413 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 TREHO43280 583 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 PLOD3O60568 738 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 CACNG1Q06432 222 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 OGFOD2Q6N063 350 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 KRT74Q7RTS7 529 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 ZBTB2Q8N680 514 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 SUSD6Q92537 303 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 ING3Q9NXR8 418 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 CASKO14936 926 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 SSNA1O43805 119 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC28A2O43868 658 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 C1RP00736 705 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 RAP2AP10114 183 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 IMPDH1P20839 514 aa11.08□□□□□ -0.64
SEMA4D-211ENST00000438547 PRKCHP24723 683 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 292.5 ms