RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 XKR3Q5GH77 459 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 IYDQ6PHW0 289 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 UNC13DQ70J99 1090 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 HTR3DQ70Z44 454 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 YAF2Q8IY57 180 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 AADATQ8N5Z0 425 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM184AQ8NB25 1140 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 NCOA7Q8NI08 942 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ADAMTS15Q8TE58 950 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PTP4A1Q93096 173 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ZBTB9Q96C00 473 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC51Q96ER9 411 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 NRBF2Q96F24 287 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MSANTD3Q96H12 275 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 C8orf76Q96K31 380 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 KCNC2Q96PR1 638 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PNKPQ96T60 521 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 APOL6Q9BWW8 343 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 STK33Q9BYT3 514 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ACPTQ9BZG2 426 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CHST8Q9H2A9 424 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 THAP9Q9H5L6 903 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 HESX1Q9UBX0 185 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CDYLQ9Y232 598 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MYH10P35580 1976 aa3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 SPTA1P02549 2419 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 SMCO2A6NFE2 343 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM233B4DJY2 109 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ACKR2O00590 384 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TRIM38O00635 465 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 NPC1O15118 1278 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CHADO15335 359 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 FOXS1O43638 330 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PIAS2O75928 621 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PRSS23O95084 383 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TRIM16O95361 564 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PGM3O95394 542 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 LARGE1O95461 756 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CAVIN2O95810 425 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 EGFP01133 1207 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CALM1P0DP23 149 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CALM2P0DP24 149 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CALM3P0DP25 149 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PCNAP12004 261 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CD59P13987 128 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PRLRP16471 622 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 BMP7P18075 431 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 COMTP21964 271 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 FDXRP22570 491 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 GLRA2P23416 452 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CHMLP26374 656 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 SFNP31947 248 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 DPP6P42658 865 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ALDH9A1P49189 494 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 GNAQP50148 359 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PEX5P50542 639 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 JAK3P52333 1124 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 PPP5CP53041 499 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 CREB5Q02930 508 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ACY1Q03154 408 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 BNIP1Q12981 228 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MAPK7Q13164 816 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 NFE2L1Q14494 772 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 EMC2Q15006 297 aa3.95□□□□□ -1.78
CYCSP43-201ENST00000438233 ADIPOQQ15848 244 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms