RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 VCYO14598 125 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PRC1O43663 620 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TACC1O75410 805 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 IRF1P10914 325 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 UGT1A1P22309 533 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 EFNB1P98172 346 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 NECTIN1Q15223 517 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM166AQ6J272 317 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PCGF6Q9BYE7 350 aa3.08□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 KPNA7A9QM74 516 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 IRAK2O43187 625 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 KRT19P08727 400 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ITIH1P19827 911 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 HLCSP50747 726 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 BLMHQ13867 455 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TEAD2Q15562 447 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RASSF1Q9NS23 344 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.07□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PLK4O00444 970 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 NBNO60934 754 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 MLYCDO95822 493 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 LIPFP07098 398 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ACADMP11310 421 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ZBTB25P24278 435 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 EPHA2P29317 976 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ANKRD1Q15327 319 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CCDC38Q502W7 563 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 USP38Q8NB14 1042 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 LINC00167Q96N53 147 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CRB3Q9BUF7 120 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 USP44Q9H0E7 712 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 P2RY12Q9H244 342 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.06□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TAF4O00268 1085 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 WISP2O76076 250 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CSPG5O95196 566 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 SETSIPP0DME0 302 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TBX4P57082 545 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 Q75L30 129 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 OR2T12Q8NG77 320 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.05□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 UTYO14607 1347 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PPR1 153 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 B9A039 149 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 IFNL4K9M1U5 179 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PLIN1O60240 522 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 IGHV3-13P01766 116 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 URODP06132 367 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 USP41Q3LFD5 358 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF843Q8N446 348 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RNF186Q9NXI6 227 aa3.04□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 EPM2AB3EWF7 344 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 GABRB2P47870 512 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 PRSS33Q8NF86 280 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RILPL2Q969X0 211 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 RFT1Q96AA3 541 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 ELP4Q96EB1 424 aa3.03□□□□□ -1.92
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms