RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 OR2A25A4D2G3 310 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 K7ENM7 598 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB43O43298 467 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TMCC2O75069 709 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LDB3O75112 727 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 MMP9P14780 707 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 IL15P40933 162 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 MMP14P50281 582 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 CD81P60033 236 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ERVFC1-1P60608 527 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 EPS8Q12929 822 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 GTF2H2Q13888 395 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZNF234Q14588 700 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 MEP1AQ16819 746 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SYT16Q17RD7 645 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SLC5A8Q8N695 610 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 POC5Q8NA72 575 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LMLNQ96KR4 655 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 GFI1Q99684 422 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SYT17Q9BSW7 474 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 MXD3Q9BW11 206 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LRMDAQ9H2I8 198 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 A0A1B0GUV1 79 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PP11 408 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LRRC72A6NJI9 287 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TMEM178BH3BS89 294 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 J3QR06 171 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZNHIT1O43257 154 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZNF217O75362 1048 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LDHCP07864 332 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SELLP14151 372 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 BDNFP23560 247 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 NRIP1P48552 1158 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 GAS1P54826 345 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PLIN5Q00G26 463 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 UBE2V1Q13404 147 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 CEP97Q8IW35 865 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 POC1AQ8NBT0 407 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 JAKMIP2Q96AA8 810 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PAFAH2Q99487 392 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PKP4Q99569 1192 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZNF711Q9Y462 761 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 LRP12Q9Y561 859 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.11□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ASPDHA6ND91 283 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 OR5K3A6NET4 321 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 A8MV72 311 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 BUB3O43684 328 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 WDR1O75083 606 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ENTPD3O75355 529 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 BEST1O76090 585 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 GH2P01242 217 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 FAM106CPP0CH98 169 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ITGB6P18564 788 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 KCNA5P22460 613 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 DGKAP23743 735 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 NMBRP28336 390 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TMF1P82094 1093 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 RUNX1T1Q06455 604 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 STK4Q13043 487 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 KRT33BQ14525 404 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TOMM20Q15388 145 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 FAM171BQ6P995 826 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM39-211ENST00000426951 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms