RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SERINC3Q13530 473 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CASC4Q6P4E1 433 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BEST2Q8NFU1 509 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CNBD2Q96M20 576 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG9Q9H6U8 611 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST12Q9NRB3 414 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGBPQ9NV56 204 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSME2Q9UL46 239 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH9Q9ULB4 789 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 YY2O15391 372 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT7LO94864 414 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNH1O95259 989 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PGLSO95336 258 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MLYCDO95822 493 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GOT2P00505 430 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GGT1P19440 569 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GGT5P36269 586 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAP31P51572 246 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD7P51665 324 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OXCT1P55809 520 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TPI1P60174 286 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BNIP2Q12982 314 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LEMD2Q8NC56 503 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3C3Q8NEB9 887 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 YIPF6Q96EC8 236 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL5Q96PQ7 755 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FICDQ9BVA6 458 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DERL2Q9GZP9 239 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LHPPQ9H008 270 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 STX16O14662 325 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NDST3O95803 873 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RBP1P09455 135 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTM2P28161 218 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPGP40121 348 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RXRGP48443 463 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PAQR3Q6TCH7 311 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF382Q96SR6 550 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINI1Q99574 410 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DSEQ9UL01 958 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MYADML2A6NDP7 307 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA7AO75326 666 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-ND1P03886 318 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN8P19075 237 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRK5P34947 590 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AVPR1AP37288 418 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM189BP81408 668 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPEQ05469 1076 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MTAPQ13126 283 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIDRQ14159 915 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GTDC1Q4AE62 458 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CPZQ66K79 652 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LETMD1Q6P1Q0 360 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PGBD3Q8N328 593 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG14Q96F25 216 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSKH2Q96QS6 385 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF11O60813 436 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC159P0C7I6 412 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A1P22309 533 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A4P22310 534 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TTKP33981 857 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A3P35503 534 aa3.59□□□□□ -1.83
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