RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTN4RQ9BZR6 473 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE7BQ9NP56 450 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R14Q9NYV8 317 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJB4Q9UDY4 337 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL3Q9Y4R7 772 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOCK7Q96N67 2140 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PP11 408 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5K3A6NET4 321 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LILRA5A6NI73 299 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C4orf47A7E2U8 309 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF587BE7ETH6 402 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM178BH3BS89 294 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOT8O14734 319 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB43O43298 467 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF217O75362 1048 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AVILO75366 819 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R3DO95685 299 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELLP14151 372 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRLRP16471 622 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGA2P17301 1181 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR2F2P24468 414 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HRH2P25021 359 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCKARP32238 428 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP14P50281 582 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUOXP51687 545 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARSEP51690 589 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSCP53634 463 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP10-11P60412 298 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP2R2BQ00005 443 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLIN5Q00G26 463 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXCL9Q07325 125 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB17Q13105 803 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2V1Q13404 147 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BECN1Q14457 450 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD2Q14681 263 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCLAFQ15004 111 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLG2Q15700 870 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR139Q6DWJ6 353 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATG9AQ7Z3C6 839 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMC9Q7Z3E5 817 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAUS6Q7Z4H7 955 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT5Q7Z7M9 940 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AACSQ86V21 672 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM219Q86XT9 240 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT13Q8IUC8 556 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCML4Q8N228 414 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC5A8Q8N695 610 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM255BQ8WV15 326 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDCA5Q96FF9 252 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL17FQ96PD4 163 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX5Q96PT3 197 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT17Q9BSW7 474 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSTL1Q9H114 145 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EBF2Q9HAK2 575 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKEF1Q9NU02 776 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM30AQ9NV96 361 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMACRQ9UHK6 382 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLAGL1Q9UM63 463 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2W1Q9Y3N9 320 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PASKQ96RG2 1323 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAF1P21675 1872 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DENND3A2RUS2 1198 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NL46 340 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMTNL1A8MU46 457 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFS4O43181 175 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNHIT1O43257 154 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM20O43506 726 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMTA2O94983 1202 aa2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms