RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 GPAMQ9HCL2 828 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ACOT9Q9Y305 439 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 IQCF5A8MTL0 148 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CCT5P48643 541 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 IRF9Q00978 393 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM69Q86WT6 500 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MDM1Q8TC05 714 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MYOCQ99972 504 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 H3BMM5 538 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJC6O75061 913 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CD6P30203 668 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CSRP3P50461 194 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MPP2Q14168 576 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 FRMD1Q8N878 549 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MGARPQ8TDB4 240 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 KCNJ9Q92806 393 aa21.62■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 GPR21Q99679 349 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 FZD3Q9NPG1 666 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MKS1Q9NXB0 559 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 INVSQ9Y283 1065 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 A0A087X1B8 175 aa21.61■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 RAD51BO15315 384 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM16O95361 564 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ITGB6P18564 788 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TSSK4Q6SA08 328 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MACC1Q6ZN28 852 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 SPNS2Q8IVW8 549 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MED16Q9Y2X0 877 aa21.61■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.6■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 GPR174Q9BXC1 333 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 WDR26Q9H7D7 661 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.6■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 AXIN1O15169 862 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 LAMTOR5O43504 91 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 FSBPO95073 299 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ZWINTO95229 277 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CHN1P15882 459 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.6■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 OR2AG1Q9H205 316 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 GALPQ9UBC7 116 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 OR1A2Q9Y585 309 aa21.6■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 OR2AG2A6NM03 316 aa21.59■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 CDK3Q00526 305 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 CLEC14AQ86T13 490 aa21.59■■□□□ 1.05
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HOXA4-201ENST00000360046 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 PANX3Q96QZ0 392 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF358Q9NW07 568 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TTC28Q96AY4 2481 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA4-201ENST00000360046 TM9SF1O15321 606 aa21.58■■□□□ 1.05
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