RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TPSAB1Q15661 275 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RGS21Q2M5E4 152 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 XKRYO14609 159 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 KAT2AQ92830 837 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SLC31A1O15431 190 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 LYPLA2O95372 231 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NMBRP28336 390 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM63Q969Q1 353 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 HAT1O14929 419 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CASKO14936 926 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 ARL2P36404 184 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CAP1Q01518 475 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 MADCAM1Q13477 382 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 GLYATQ6IB77 296 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 C9P02748 559 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC20A2Q08357 652 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ART5Q96L15 291 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 INSIG1O15503 277 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SNX27Q96L92 541 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CCNCP24863 283 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LRCH4O75427 683 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 STK16O75716 305 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN2P17706 415 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R2BQ00005 443 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 VITQ6UXI7 678 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 HERVK_113Q902F9 699 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 HBEGFQ99075 208 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 S100GP29377 79 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 KIR3DL1P43629 444 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 QPCTQ16769 361 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF567Q8N184 647 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 GRIN2DO15399 1336 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 IL23RQ5VWK5 629 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 MED27Q6P2C8 311 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PIGUQ9H490 435 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 TPST2O60704 377 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 UBXN11Q5T124 520 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 BEND5Q7L4P6 421 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 COL20A1Q9P218 1284 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 17.3
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LCN9Q8WX39 176 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 B3GALT6Q96L58 329 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ATCAYQ86WG3 371 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 LIX1Q8N485 282 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 AP3S1Q92572 193 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PSMG2Q969U7 264 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD3Q96ES6 412 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PER2O15055 1255 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 AP2A1O95782 977 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ARFIP1P53367 373 aa22.18■■□□□ 1.14
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