RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 POLBP06746 335 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FOXN2P32314 431 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 SLC7A5Q01650 507 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CBLBQ13191 982 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 BBS9Q3SYG4 887 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CES3Q6UWW8 571 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 LRRTM4Q86VH4 590 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINA9Q86WD7 417 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD3Q9Y2F9 522 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 OR51F1A6NGY5 319 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FFAR2O15552 330 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CBFA2T3O75081 653 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 USP1O94782 785 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 VAPBO95292 243 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TTC4O95801 387 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CTBSQ01459 385 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PIANPQ8IYJ0 282 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ART4Q93070 314 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CATSPERZQ9NTU4 200 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 GRHL1Q9NZI5 618 aa26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 GIMD1P0DJR0 217 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PGAM1P18669 254 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ITIH4Q14624 930 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB133Q30KQ1 61 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 MSS51Q4VC12 460 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 SEC14L1Q92503 715 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 GLMNQ92990 594 aa26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ13O60928 360 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CEACAM1P13688 526 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 GUCY2DQ02846 1103 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM220Q6QAJ8 160 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FAM181AQ8N9Y4 354 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CCL4L1Q8NHW4 92 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PRKAB1Q9Y478 270 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FAM169AQ9Y6X4 670 aa26.4■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM38O00635 465 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 SIGLEC6O43699 453 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PRSS56P0CW18 603 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 NSG1P42857 185 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TTPAP49638 278 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PLTPP55058 493 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 DBN1Q16643 649 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 MRNIPQ6NTE8 343 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CRTC3Q6UUV7 619 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CENPUQ71F23 418 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 NRROSQ86YC3 692 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB124Q8NES8 71 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PWWP2AQ96N64 755 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TIMM29Q9BSF4 260 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FOXP3Q9BZS1 431 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FAM114A2Q9NRY5 505 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 EVA1BQ9NVM1 165 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FTSJ1Q9UET6 329 aa26.39■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL33A6NCF5 533 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 E7ESA3 106 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 PFDN6O15212 129 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 VCLP18206 1134 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 ARNTP27540 789 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 ELK3P41970 407 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 CLCNKAP51800 687 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 B4GALNT1Q00973 533 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 TCEA2Q15560 299 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 LONRF1Q17RB8 773 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF547Q8IVP9 402 aa26.39■■□□□ 1.81
CRIP1-201ENST00000330233 GPR150Q8NGU9 434 aa26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms