RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3-202ENST00000327307 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3-202ENST00000327307 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.9□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MEIS1O00470 390 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PPIP5K2O43314 1243 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 COCHO43405 550 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PFKFB2O60825 505 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLC2A3P11169 496 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SRCP12931 536 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 AREGP15514 252 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CMA1P23946 247 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RYKP34925 604 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KCNJ1P48048 391 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 BCAP31P51572 246 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ITGA1P56199 1179 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TRAF2Q12933 501 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PRKAA1Q13131 559 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GTDC1Q4AE62 458 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 COLEC12Q5KU26 742 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GHDCQ8N2G8 530 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CCNYQ8ND76 341 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PROX1Q92786 737 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DGAT2Q96PD7 388 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NLNQ9BYT8 704 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PKIBQ9C010 78 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RAB17Q9H0T7 212 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CHODLQ9H9P2 273 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NDE1Q9NXR1 346 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NYAP2Q9P242 653 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 POLLQ9UGP5 575 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CFAP73A6NFT4 308 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 POTEB2H3BUK9 544 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TRIM77I1YAP6 450 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HRKO00198 91 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MATN2O00339 956 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 AQP7O14520 342 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GNB5O14775 395 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RHOBTB1O94844 696 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OR6B1O95007 311 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PLA2G4BP0C869 781 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TCF4P15884 667 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FUT1P19526 365 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GSTM2P28161 218 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ADH6P28332 368 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CD79BP40259 229 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ERFP50548 548 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CDH4P55283 916 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ATP11AP98196 1134 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OLIG2Q13516 323 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ALCAMQ13740 583 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TAZQ16635 292 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MLIPQ5VWP3 458 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LIPNQ5VXI9 398 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DENND2CQ68D51 928 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CDC73Q6P1J9 531 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CHST9Q7L1S5 443 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF786Q8N393 782 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FBXL16Q8N461 479 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms