RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM74Q96NL1 305 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDH14Q9HBH5 336 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETNK1Q9HBU6 452 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB41L5Q9HCM4 733 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASCL3Q9NQ33 180 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM8Q9NQV8 689 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD6Q8TD26 2715 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL22O00626 93 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP104O60308 925 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE6O95741 557 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A4P14672 509 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD1CP29017 333 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCR5P32302 372 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTN2P35609 894 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 FDFT1P37268 417 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS15P98073 1019 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFATC2Q13469 925 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 MICALCLQ6ZW33 695 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 REXO1L1PQ8IX06 675 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSMEM2Q8N112 164 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT22Q9BRQ3 303 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB8Q9H765 288 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0G2JNG1 304 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP14A8MT82 685 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUN1O94901 812 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF2RBP32927 897 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 HHEXQ03014 270 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA5AQ13591 1074 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU6F1Q14863 301 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS5Q14953 304 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKAIN2Q5VXU1 208 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00523Q86TU6 105 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC89Q8N998 374 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAIP1Q8WWC4 291 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF11Q92914 225 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC25Q96NG3 672 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 STRADBQ9C0K7 418 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK4Q9NYG8 393 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFHX4Q86UP3 3567 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WV48 116 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5K4A6NMS3 321 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZW10O43264 779 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKT1P31749 480 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 HADHAP40939 763 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPT6Q14141 434 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 LONRF2Q1L5Z9 754 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP53Q70EK8 1073 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9B2Q86UD5 537 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCBLD2Q96PD2 775 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC38A3Q99624 504 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA6CQ9H3T2 930 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB6BQ9NRW1 208 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAK5Q9P286 719 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS20P59510 1910 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM208BQ5VWN6 2430 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2AG2A6NM03 316 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDZK1P1A8MUH7 402 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 H7C0S8 307 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLD2O14939 933 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRAFP15056 766 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSH3P20585 1137 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGALP20701 1170 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 MC4RP32245 332 aa19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms