RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 SPAG4Q9NPE6 437 aa21.51■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 TIMM22Q9Y584 194 aa21.51■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.5■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.5■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa21.49■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 ACRV1P26436 265 aa21.49■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SPAM1P38567 509 aa21.49■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 ECT2LQ008S8 904 aa21.49■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 LMLNQ96KR4 655 aa21.49■■□□□ 1.03
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SPHK1-201ENST00000323374 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CHRNA6Q15825 494 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SFT2D3Q587I9 215 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SBSNQ6UWP8 590 aa21.47■■□□□ 1.03
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