RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320159.2

ZNF48-201, Transcript of zinc finger protein 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF48, Length 3,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48-201ENST00000320159 A0A0C4DFX4 3053 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 FASP25445 335 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 GTDC1Q4AE62 458 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 KANK2Q63ZY3 851 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 MYLIPQ8WY64 445 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 HACD3Q9P035 362 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SLC22A2O15244 555 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 PRKACGP22612 351 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 GPSM1Q86YR5 675 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 BIRC8Q96P09 236 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 NANOGQ9H9S0 305 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 GALNT8Q9NY28 637 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 DMTF1Q9Y222 760 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 PFDN1O60925 122 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 NDST3O95803 873 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 GALNT10Q86SR1 603 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 ANKRD46Q86W74 232 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 FGF1P05230 155 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 RHOCP08134 193 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 CLCN2P51788 898 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 XKR5Q6UX68 686 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 RNF38Q9H0F5 515 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 AP1G1O43747 822 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SLC22A3O75751 556 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 OR1D2P34982 312 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SLC11A1P49279 550 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 ENTPD1P49961 510 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 TRAF2Q12933 501 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 RNF175Q8N4F7 328 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 EGFL8Q99944 293 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SEPT4O43236 478 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 TCF3P15923 654 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 MERTKQ12866 999 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 EID2BQ96D98 161 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 SCLYQ96I15 445 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 RNF186Q9NXI6 227 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF48-201ENST00000320159 FAM163BP0C2L3 166 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 CD247P20963 164 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 PMS2P3Q13401 168 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 TFAP2CQ92754 450 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 SMURF2Q9HAU4 748 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 A0A1W2PPW3 197 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 KERAO60938 352 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 OAZ2O95190 189 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 SLC2A4P14672 509 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 TYMPP19971 482 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 HLA-DPA1P20036 260 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 PLD1Q13393 1074 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 INPP5AQ14642 412 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 IMPG1Q17R60 797 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 SFRP1Q8N474 314 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 TEX26Q8N6G2 289 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 KIAA1191Q96A73 305 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 BIRC7Q96CA5 298 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 SLC22A12Q96S37 553 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF48-201ENST00000320159 CHID1Q9BWS9 393 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms