RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 MSLNLQ96KJ4 702 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 BIRC8Q96P09 236 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM245Q9H330 911 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM83DQ9H4H8 585 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 POMKQ9H5K3 350 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NPHS2Q9NP85 383 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CD207Q9UJ71 328 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM50BQ9Y247 325 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JND7 137 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP14A8MT82 685 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 TARM1B6A8C7 271 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1I1O60431 355 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA4LO95757 839 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHX1P07099 455 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 TFEBP19484 476 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SP100P23497 879 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB5P36952 375 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NSG1P42857 185 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ARFIP2P53365 341 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PGGT1BP53609 377 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB13P59910 316 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 IL2P60568 153 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 OVGP1Q12889 678 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DLG1Q12959 904 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 COL19A1Q14993 1142 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP157Q5JU67 520 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ISCA2Q86U28 154 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NRSN1Q8IZ57 195 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NXPE1Q8N323 547 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF366Q8N895 744 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SMRP1Q8NCR6 262 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RHEBL1Q8TAI7 183 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP5DQ92835 1189 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM129BQ96TA1 746 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 COPS8Q99627 209 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR21Q99679 349 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY13Q9BPV8 354 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DERL2Q9GZP9 239 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 MTG2Q9H4K7 406 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 XPR1Q9UBH6 696 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GNPTGQ9UJJ9 305 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SYCE1LA8MT33 242 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ANHXE9PGG2 379 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y858 1186 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD11O00231 422 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NEMP1O14524 444 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DLX3O60479 287 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM24O75264 130 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 IPO13O94829 963 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSLP07711 333 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-EP13747 358 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CD1DP15813 335 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ACRV1P26436 265 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS4P49798 205 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GALK1P51570 392 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NAGLUP54802 743 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NAA20P61599 178 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB16Q05516 673 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 MESP2Q0VG99 397 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CLN3Q13286 438 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DOC2BQ14184 412 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CRY1Q16526 586 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF284Q2VY69 593 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SDE2Q6IQ49 451 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CGB2Q6NT52 195 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM207Q6UWW9 146 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DPPA4Q7L190 304 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CNDP1Q96KN2 507 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY12Q9H244 342 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PRO3102Q9H379 93 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms