RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 COPS8Q99627 209 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SUN2Q9UH99 717 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 H0Y858 1186 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UBXN8O00124 270 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DRD3P35462 400 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY2P41231 377 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NSG1P42857 185 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 AQP5P55064 265 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC13P55735 322 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 IL2P60568 153 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNTL6Q49A17 601 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LINGO1Q96FE5 620 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 EBF4Q9BQW3 602 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPC1 479 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MTX2O75431 263 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UBOX5O94941 541 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPA4LO95757 839 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NFKBIAP25963 317 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TIE1P35590 1138 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF4P43489 277 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD8P48556 350 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NFKB2Q00653 900 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LRCH3Q96II8 777 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK12Q9HB15 430 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HAO1Q9UJM8 370 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD11O00231 422 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SGTAO43765 313 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KERAO60938 352 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM16O95361 564 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SOD1P00441 154 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MPSTP25325 297 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V0D1P61421 351 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTN1Q12860 1018 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOX1Q15067 660 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 AADATQ8N5Z0 425 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SKA1Q96BD8 255 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ULK4Q96C45 1275 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HDAC8Q9BY41 377 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HEY2Q9UBP5 337 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 BTN3A1O00481 513 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MBTPS2O43462 519 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINB3P29508 390 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HK3P52790 923 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SATB1Q01826 763 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBB3Q13509 450 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CACUL1Q86Y37 369 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 AGR3Q8TD06 166 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 INPP5DQ92835 1189 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 EXT2Q93063 718 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC126Q96EE4 140 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DTD2Q96FN9 168 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH19Q9H159 772 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 WNT9AO14904 365 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NPHS1O60500 1241 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms