RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 LCP2Q13094 533 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF6Q15052 776 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CHRNA6Q15825 494 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 AAGABQ6PD74 315 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ACOT8O14734 319 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FFAR3O14843 346 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR42O15529 346 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FZD6O60353 706 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TPST1O60507 370 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LRG1P02750 347 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PYGLP06737 847 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HMGCLP35914 325 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SGO1Q5FBB7 561 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 DLG3Q92796 817 aa15.63■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 BPIP17213 487 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC26A3P40879 764 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HSPA7P48741 367 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CLCN7P51798 805 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 STX1BP61266 288 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 UFM1P61960 85 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PHKG1Q16816 387 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 Q6ZNB5 142 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PDSS2Q86YH6 399 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PEX13Q92968 403 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PCTPQ9UKL6 214 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 V9GYQ6 96 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PSMC3P17980 439 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LAMB3Q13751 1172 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TRANK1O15050 2925 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LEFTY2O00292 366 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 INHBCP55103 352 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 STX5Q13190 355 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR26Q8NDV2 337 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FAR2Q96K12 515 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PIDD1Q9HB75 910 aa15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 UGT2B4P06133 528 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NFKB2Q00653 900 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RABL3Q5HYI8 236 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CHST14Q8NCH0 376 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GATA6Q92908 595 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TRMOQ9BU70 441 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 COL4A6Q14031 1691 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 E2F3O00716 465 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LYNP07948 512 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SATB1Q01826 763 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 KANK2Q63ZY3 851 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RETSATQ6NUM9 610 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 JADE3Q92613 823 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LRGUKQ96M69 825 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM74Q96NL1 305 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CLPBQ9H078 707 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 A6NHS1 94 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MT-ND1P03886 318 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CAPN1P07384 714 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 VCLP18206 1134 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NFATC2Q13469 925 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 Q6ZVU0 165 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ING5Q8WYH8 240 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CROTQ9UKG9 612 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.61■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM149AA5PLN7 773 aa15.6■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TRBC1P01850 177 aa15.6■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms