RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 COL4A2P08572 1712 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FAM159BA6NKW6 160 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 OCM2P0CE71 109 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GKP32189 559 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK1DP48730 415 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZVU0 165 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PRLP01236 227 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 EPOP01588 193 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GSTT2P0CG29 244 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GSTT2BP0CG30 244 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PGAM1P18669 254 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 POU6F1Q14863 301 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 VOPP1Q96AW1 172 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NUF2Q9BZD4 464 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 KCNK12Q9HB15 430 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TTC34A8MYJ7 566 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 BNIP3LO60238 219 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 GSRP00390 522 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 BMP1P13497 986 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DPA1P20036 260 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FRS2Q8WU20 508 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PIGNO95427 931 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NDST3O95803 873 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 KCNA4P22459 653 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 STEAP4Q687X5 459 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CES3Q6UWW8 571 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 FGF1P05230 155 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 HSPA13P48723 471 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CREB5Q02930 508 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 KAT7O95251 611 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 PRKCGP05129 697 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NNMTP40261 264 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK8P45983 427 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CARD16Q5EG05 197 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 LILRA2Q8N149 483 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 RANBP9Q96S59 729 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 NAT9Q9BTE0 207 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.14■□□□□ 0.82
UBE2B-201ENST00000265339 ANTXRLA6NF34 631 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 ALDH3B2P48448 385 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 BCAP31P51572 246 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF366Q8N895 744 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 MTG2Q9H4K7 406 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 EBF1Q9UH73 591 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 EMCNQ9ULC0 261 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC78A2IDD5 438 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 DCXO43602 365 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 FZD6O60353 706 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 ASGR2P07307 311 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 SLC1A6P48664 564 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB9P50453 376 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms