RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 SNX2O60749 519 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RHOBTB1O94844 696 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ESRRBO95718 433 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 BCL10O95999 233 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MLLT10P55197 1068 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GNA12Q03113 381 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ATP1A4Q13733 1029 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 DAG1Q14118 895 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SPIDRQ14159 915 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GALNT3Q14435 633 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TMBIM1Q969X1 311 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SLC39A13Q96H72 371 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SEMA3CQ99985 751 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.79□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FAM234BA2RU67 622 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TMEM221A6NGB7 291 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ABCB7O75027 752 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SULT1C4O75897 302 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PRSS23O95084 383 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ALPLP05186 524 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 UROSP10746 265 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 BCAP31P51572 246 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ERVK-8P63133 956 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SELPLGQ14242 412 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NR1D2Q14995 579 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 HID1Q8IV36 788 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SGCDQ92629 289 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PEX13Q92968 403 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ING2Q9H160 280 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SELENONQ9NZV5 590 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SUN2Q9UH99 717 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PCTPQ9UKL6 214 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 LCHNA4D1U4 455 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SERPINB7O75635 380 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 POMCP01189 267 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 THRBP10828 461 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FMO4P31512 558 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TUBA3CQ13748 450 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 INIPQ9NRY2 104 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PSME2Q9UL46 239 aa14.78□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 MUSKO15146 869 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 KCNH1O95259 989 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CHEK2O96017 543 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 FGF1P05230 155 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 PCNAP12004 261 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 HLA-DPA1P20036 260 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CRHBPP24387 322 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 KCNC4Q03721 635 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 IGSF8Q969P0 613 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 ESAMQ96AP7 390 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 HGH1Q9BTY7 390 aa14.77□□□□□ -0.04
SYP-201ENST00000263233 CFAP99D6REC4 459 aa14.77□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 M0QZQ0 153 aa14.77□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 STX16O14662 325 aa14.77□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 KLK8O60259 260 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms