RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALPLP05186 524 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNPLA4P41247 253 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP2K4P45985 399 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLD2P49005 469 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 C6orf183Q5T699 404 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAIR2Q6ISS4 152 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FKBP10Q96AY3 582 aa21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 JRKO75564 520 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJB1P25685 340 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FMO4P31512 558 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL1RL1Q01638 556 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD47Q08722 323 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 DAG1Q14118 895 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 INAVAQ3KP66 663 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPESP1Q6UW49 350 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAD1Q99259 594 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRMOQ9BU70 441 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 BDH2Q9BUT1 245 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 MIOSQ9NXC5 875 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO10Q9UK96 956 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 POU2F3Q9UKI9 436 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 BAG5Q9UL15 447 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP3B1O00203 1094 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GABRDO14764 452 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC22A3O75751 556 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP4B1P13584 511 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 VBP1P61758 197 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX17Q15036 470 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBBP7Q16576 425 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMCESQ96FZ2 354 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FCGR1AP12314 374 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 IDO1P14902 403 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GP2P55259 537 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNC4Q03721 635 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 RCAN2Q14206 197 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCL14Q16627 93 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM54Q9BYV2 358 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIAEQ9HAT2 523 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF112Q9ULX5 631 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 F8W810 466 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TREHO43280 583 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 F9P00740 461 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMP3P08254 477 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTR6P50406 440 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 AIF1P55008 147 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPRRQ15256 657 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB41Q5JT25 222 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITFG1Q8TB96 612 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMG2Q969U7 264 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 MBOAT4Q96T53 435 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTRRQ9UBK8 725 aa21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC2A3P11169 496 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALDH3A2P51648 485 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNAB2Q13303 367 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 OXA1LQ15070 435 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 A6NL46 340 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 ECI2O75521 394 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4F21O95013 312 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMP2P08253 660 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITGB6P18564 788 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIK3CGP48736 1102 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIMKLAQ8IXN7 391 aa21.01■□□□□ 0.95
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM199Q8N511 208 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms