RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CDKL2Q92772 493 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ULK4Q96C45 1275 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CYTH2Q99418 400 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ZFATQ9P243 1243 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CRLS1Q9UJA2 301 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SYF2O95926 243 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 KELP23276 732 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TYSND1Q2T9J0 566 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TPRG1LQ5T0D9 272 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ENPP7Q6UWV6 458 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CERS6Q6ZMG9 384 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R42Q7RTR8 314 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PARGQ86W56 976 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CILP2Q8IUL8 1156 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 DENND6AQ8IWF6 608 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 NXPE1Q8N323 547 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 OTUD6BQ8N6M0 293 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 OR2I1PQ8NGU4 316 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 BTN2A2Q8WVV5 523 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 WDR92Q96MX6 357 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TEX101Q9BY14 249 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM9BQ9NQ34 198 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 RXFP3Q9NSD7 469 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SLC17A6Q9P2U8 582 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 INPP4BO15327 924 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 DFNA5O60443 496 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 PIAS1O75925 651 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 IVLP07476 585 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 SLC1A2P43004 574 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 NAB1Q13506 487 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 FZD2Q14332 565 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF423Q2M1K9 1284 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL38Q2WGJ6 581 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0408Q6ZU52 694 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINA9Q86WD7 417 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA1Q8N8W4 532 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 OR2W6PQ8NHA6 318 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 GLYATL1Q969I3 302 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 HIC2Q96JB3 615 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 TCF12Q99081 682 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 LGR4Q9BXB1 951 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC28Q9NX36 388 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 KLQ9UEF7 1012 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO5Q9UKT4 447 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 H3BQF6 201 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 ACRV1P26436 265 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 OAS2P29728 719 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 TTPAP49638 278 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 CCT8P50990 548 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 CTBP1Q13363 440 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 DBN1Q16643 649 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 KRT71Q3SY84 523 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 GALNT7Q86SF2 657 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 SLC26A11Q86WA9 606 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 DDHD1Q8NEL9 900 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 COX14Q96I36 57 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 PPCSQ9HAB8 311 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 VPS18Q9P253 973 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 MOSPD1Q9UJG1 213 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 GDF9O60383 454 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 TCEA3O75764 348 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 S1PR4O95977 384 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 SHBGP04278 402 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 MPP1Q00013 466 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 ITIH4Q14624 930 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF542PQ5EBM4 170 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 DOK6Q6PKX4 331 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM74Q86UV6 250 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC6Q86X45 466 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 CTAGE3PQ8IX95 158 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD11-201ENST00000249504 PPM1NQ8N819 430 aa19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.1 ms