RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 NEMP2A6NFY4 417 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB14O43829 449 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PSMG1O95456 288 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 LBPP18428 481 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CDH13P55290 713 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 GTF2H3Q13889 308 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PTK2BQ14289 1009 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CYTH1Q15438 398 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 COPS8Q99627 209 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 TLR9Q9NR96 1032 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 A8MUI8 341 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 MATN2O00339 956 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFB5O43674 189 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 LDB2O43679 373 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 C1QAP02745 245 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEA12P43365 314 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PTPRCAPQ14761 206 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 TECRLQ5HYJ1 363 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 ASRGL1Q7L266 308 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 GPR150Q8NGU9 434 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 LZTS1Q9Y250 596 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 SOCS5O75159 536 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CTSEP14091 401 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 GDI1P31150 447 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PIK3CGP48736 1102 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CCNG1P51959 295 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 SEC13P55735 322 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CLEC14AQ86T13 490 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CATSPER1Q8NEC5 780 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 KCNK13Q9HB14 408 aa10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 SHROOM3Q8TF72 1996 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KDM1AO60341 852 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KRT75O95678 551 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ADH1CP00326 375 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TSPAN8P19075 237 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MSH3P20585 1137 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HERVK_113P63132 956 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NCEH1Q6PIU2 408 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SNX20Q7Z614 316 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MIER2Q8N344 545 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PGBD5Q8N414 524 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 METTL6Q8TCB7 284 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TDP1Q9NUW8 608 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DOCK4Q8N1I0 1966 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KLKB1P03952 638 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 UGT2B4P06133 528 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GMPRP36959 345 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PFKPQ01813 784 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CBX3Q13185 183 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DMC1Q14565 340 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GPR33Q49SQ1 333 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SZRD1Q7Z422 152 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PIM3Q86V86 326 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SNX31Q8N9S9 440 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf21Q9H246 121 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LCHNA4D1U4 455 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MROH6A6NGR9 719 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 UBXN8O00124 270 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KPNA5O15131 536 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KERAO60938 352 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PGLSO95336 258 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GUCA1CO95843 209 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LCP2Q13094 533 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MPP7Q5T2T1 576 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LAYNQ6UX15 382 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms