RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228468.8

ASIC1-201, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ASIC1, Length 4,072 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1-201ENST00000228468 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MGAT4DA6NG13 374 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 CST1P01037 141 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 FESP07332 822 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 RHDQ02161 417 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 DMC1Q14565 340 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 HERC3Q15034 1050 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 RBFAQ8N0V3 343 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 TAGAPQ8N103 731 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SH3GL1Q99961 368 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 HIPK3Q9H422 1215 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PRAMEF11O60813 436 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 UROSP10746 265 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 OR4D1Q15615 310 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 KBTBD6Q86V97 674 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 P3H2Q8IVL5 708 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MICU2Q8IYU8 434 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 OR10A6Q8NH74 314 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PTERQ96BW5 349 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 COPS8Q99627 209 aa15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 H3BSA7 217 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 WDR47O94967 919 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 OR56A5P0C7T3 313 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SLC7A1P30825 629 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PRIM2P49643 509 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SPIDRQ14159 915 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 RTP2Q5QGT7 225 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 GPR156Q8NFN8 814 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ELMO1Q92556 727 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 APOLD1Q96LR9 279 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 CYP4B1P13584 511 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 FOXA1P55317 472 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 TNK2Q07912 1038 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 IKBKEQ14164 716 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PTPRRQ15256 657 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF284Q2VY69 593 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 C17orf99Q6UX52 265 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SYT12Q8IV01 421 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 DYRK4Q9NR20 520 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MTX2O75431 263 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 MSH3P20585 1137 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 GTF2H2Q13888 395 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 C11orf74Q86VG3 221 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF558Q96NG5 402 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 BBS2Q9BXC9 721 aa15.97■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 UTRNP46939 3433 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 AOC2O75106 756 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 POU1F1P28069 291 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 AQP1P29972 269 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 SEMA3BQ13214 749 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 PIGGQ5H8A4 983 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ADI1Q9BV57 179 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 CHID1Q9BWS9 393 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 KERAO60938 352 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 CD1DP15813 335 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 CSKP41240 450 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 GSK3BP49841 420 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 RAD23AP54725 363 aa15.96■□□□□ 0.15
ASIC1-201ENST00000228468 CYP4F8P98187 520 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms