RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rslcan18Q7M6X5 460 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmo9Q8C116 539 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ThtpaQ8JZL3 224 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc30a5Q8R4H9 761 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr665Q8VG79 316 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c70Q91W64 489 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad51cQ924H5 366 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs10Q9CQE5 181 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf186Q9D241 226 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Batf3Q9D275 118 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc46Q9DAP0 323 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PyglQ9ET01 850 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag4Q9JJF2 443 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkl2Q9QUK0 568 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col12a1Q60847 3120 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3604A0A087WPN2 559 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SmoktcrA2KF29 484 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1600015I10RikE9Q745 711 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2w1E9Q816 493 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atn1O35126 1175 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Socs2O35717 198 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01740 135 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdx3P20108 257 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PenkP22005 268 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adra2bP30545 450 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csf3rP40223 837 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epb41P48193 858 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arf5P84084 180 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Axdnd1Q3UZ57 424 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lemd2Q6DVA0 511 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casc4Q6P2L7 435 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc15Q78YY6 149 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf423Q80TS5 1292 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab36Q8CAM5 267 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp10Q8CCN1 673 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a9Q8VDT1 685 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KmoQ91WN4 479 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hormad1Q9D5T7 392 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gprc5dQ9JIL6 344 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il20Q9JKV9 176 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam17Q9Z0F8 827 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep290Q6A078 2472 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Umodl1Q5DID3 1319 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna1dQ99246 2179 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpm6Q8CIR4 2028 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc120A2AEV7 629 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk4O88454 398 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpcP49452 906 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab10P61027 200 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OxtrP97926 388 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dyrk2Q5U4C9 599 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MogQ61885 246 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfe2l1Q61985 741 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C5ar2Q8BW93 344 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc34Q8C0Q3 554 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frs2Q8C180 508 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Impg1Q8R1W8 798 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1019Q8VGS3 310 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult5a1Q91X36 291 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsl24d1Q99L28 163 aa12.56□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cylc2B1AWN8 422 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlx2P40764 332 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpc4P51655 557 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sephs2P97364 452 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adra1dP97714 562 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SirpaP97797 513 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ebf1Q07802 591 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osbp2Q5QNQ6 908 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lingo3Q6GQU6 589 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7247Q6UY52 187 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amigo1Q80ZD8 492 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc46a2Q8CA03 479 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BfarQ8R079 450 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif19Q99PT9 997 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MydgfQ9CPT4 166 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D937 123 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsmQ9JL96 333 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trip4Q9QXN3 581 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn3Q9Z0G9 219 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HephQ9Z0Z4 1157 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eml5Q8BQM8 1977 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnrc18Q80WC3 2878 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts14E9PX39 1209 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gria2P23819 883 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man1a1P45700 655 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArsaP50428 506 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SmoP56726 793 aa12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.6 ms