RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624484.1

CU633906.4-201, humanhuman

BASIC

Gene CU633906.4, Length 1,023 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633906.4-201ENST00000624484 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 ALS2Q96Q42 1657 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 SBNO1A3KN83 1393 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 ARHGEF10O15013 1369 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 PSME1Q06323 249 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 USP31Q70CQ4 1352 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 BCAR3O75815 825 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 PDE3AQ14432 1141 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 NFE2L2Q16236 605 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 SSH2Q76I76 1423 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 HMOX1P09601 288 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633906.4-201ENST00000624484 APBA3O96018 575 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 MS4A1P11836 297 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 USP54Q70EL1 1684 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 PIK3C2AO00443 1686 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 AAMPQ13685 434 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 PEAK1Q9H792 1746 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 AMPHP49418 695 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 NLRP6P59044 892 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 SPON1Q9HCB6 807 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 FLT4P35916 1363 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 CHD4Q14839 1912 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 SOX12O15370 315 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 GNAI1P63096 354 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 CASZ1Q86V15 1759 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 KCNQ2O43526 872 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 ABTB2Q8N961 1025 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633906.4-201ENST00000624484 NBPF14Q5TI25 921 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 ZNF428Q96B54 188 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 IFT57Q9NWB7 429 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 CHRNA2Q15822 529 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 STRN4Q9NRL3 753 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 USP35Q9P2H5 1018 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 KIF16BQ96L93 1317 aa13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 ALDH1L2Q3SY69 923 aa13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 IFFO2Q5TF58 517 aa13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 PANK1Q8TE04 598 aa13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 COG6Q9Y2V7 657 aa13□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 SBF2Q86WG5 1849 aa12.99□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 KIAA0232Q92628 1395 aa12.99□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.99□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.98□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.98□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 LTN1O94822 1766 aa12.98□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 RTL1A6NKG5 1358 aa12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 CFAP44Q96MT7 982 aa12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CU633906.4-201ENST00000624484 ZNF853P0CG23 659 aa12.95□□□□□ -0.34
CU633906.4-201ENST00000624484 HOXC9P31274 260 aa12.95□□□□□ -0.34
CU633906.4-201ENST00000624484 C1QTNF8P60827 252 aa12.95□□□□□ -0.34
CU633906.4-201ENST00000624484 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CU633906.4-201ENST00000624484 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CU633906.4-201ENST00000624484 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms