RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619922.1

PRAMEF11-201, Transcript of PRAME family member 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF11, Length 1,845 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11-201ENST00000619922 EYA1Q99502 592 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 NFAT5O94916 1531 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 IFT57Q9NWB7 429 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 ABCA3Q99758 1704 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 GNAI1P63096 354 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 PDE3AQ14432 1141 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 IP6K1Q92551 441 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 KDRP35968 1356 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF11-201ENST00000619922 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 SLIT3O75094 1523 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 FAM83GA6ND36 823 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 MS4A1P11836 297 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 GLI3P10071 1580 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 PLEKHG5O94827 1062 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 GCP02774 474 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 DCTN1Q14203 1278 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 USP19O94966 1318 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ZNF853P0CG23 659 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 CFAP44Q96MT7 982 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 LTN1O94822 1766 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 SLIT2O94813 1529 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 MBIPQ9NS73 344 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 PANK1Q8TE04 598 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 MCM10Q7L590 875 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ZNF428Q96B54 188 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 USP35Q9P2H5 1018 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 COG6Q9Y2V7 657 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF11-201ENST00000619922 ALS2Q96Q42 1657 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 CCDC125Q86Z20 511 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 TNNQ9UQP3 1299 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 VAMP4O75379 141 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 NBPF4Q96M43 638 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 KIF16BQ96L93 1317 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 NRAPQ86VF7 1730 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 RLBP1P12271 317 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 TSPYL6Q8N831 410 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 CRB1P82279 1406 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 CHL1O00533 1208 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 AAMPQ13685 434 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 MAP3K5Q99683 1374 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 TRIM27P14373 513 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF11-201ENST00000619922 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 KIAA0232Q92628 1395 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 NCAPD2Q15021 1401 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF11-201ENST00000619922 BACH2Q9BYV9 841 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms