RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619533.1

CNTNAP4-208, Transcript of contactin associated protein like 4, human

Gene CNTNAP4, Length 1,856 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	COG3	Q96JB2	828 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	STK32B	Q9NY57	414 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ERBB3	P21860	1342 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SBF2	Q86WG5	1849 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IP6K1	Q92551	441 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TESK2	Q96S53	571 aa		8.45	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TNS2	Q63HR2	1409 aa		8.44	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	USP54	Q70EL1	1684 aa		8.44	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TXNRD1	Q16881	649 aa		8.44	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	8.44	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	8.44	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		8.44	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	AMPH	P49418	695 aa		8.43	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TMF1	P82094	1093 aa		8.43	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PROM2	Q8N271	834 aa		8.43	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LTN1	O94822	1766 aa		8.43	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZBTB7A	O95365	584 aa		8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC15A2	Q16348	729 aa		8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CDCA8	Q53HL2	280 aa		8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	USP47	Q96K76	1375 aa		8.41	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HOXC9	P31274	260 aa		8.4	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NHS	Q6T4R5	1651 aa		8.4	□□□□□ -1.06
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FBLN1	P23142	703 aa		8.4	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	8.4	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		8.4	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	8.39	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FYB1	O15117	783 aa		8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CASZ1	Q86V15	1759 aa		8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RTL1	A6NKG5	1358 aa		8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	YY1	P25490	414 aa		8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MTFR1L	Q9H019	292 aa		8.38	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	8.37	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		8.37	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		8.37	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PTGER2	P43116	358 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NBPF4	Q96M43	638 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	BTAF1	O14981	1849 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC4A2	P04920	1241 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF827	Q17R98	1081 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		8.36	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		8.35	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MYOM1	P52179	1685 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	AKT1S1	Q96B36	256 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	INSR	P06213	1382 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MEGF6	O75095	1541 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	POLD1	P28340	1107 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SYT17	Q9BSW7	474 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	8.34	□□□□□ -1.07
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FLT4	P35916	1363 aa		8.34	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		8.34	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PAPPA	Q13219	1627 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KCNQ4	P56696	695 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		8.33	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NSD2	O96028	1365 aa		8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SPG7	Q9UQ90	795 aa		8.31	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		8.3	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		8.3	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	8.3	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	GPR162	Q16538	588 aa		8.3	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MAP3K5	Q99683	1374 aa		8.29	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		8.29	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CYP27B1	O15528	508 aa		8.29	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	8.29	□□□□□ -1.08
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NBR1	Q14596	966 aa		8.29	□□□□□ -1.08

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