RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-220	ENST00000618056	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.91	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	EYA1	Q99502	592 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
PMS1-220	ENST00000618056	PLSCR1	O15162	318 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	BTAF1	O14981	1849 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	KCNQ2	O43526	872 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.82	■■■■□ 3.01
PMS1-220	ENST00000618056	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.82	■■■■□ 3
PMS1-220	ENST00000618056	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.81	■■■■□ 3
PMS1-220	ENST00000618056	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.81	■■■■□ 3
PMS1-220	ENST00000618056	MTHFS	P49914	203 aa		33.79	■■■■□ 3
PMS1-220	ENST00000618056	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.77	■■■■□ 3	5e-7	■■■□□ 15.2
PMS1-220	ENST00000618056	IL13	P35225	146 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PMS1-220	ENST00000618056	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PMS1-220	ENST00000618056	CYP27B1	O15528	508 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PMS1-220	ENST00000618056	PROM2	Q8N271	834 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PMS1-220	ENST00000618056	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
PMS1-220	ENST00000618056	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	KDR	P35968	1356 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	ITGB4	P16144	1822 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	TXNRD1	Q16881	649 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	LY75	O60449	1722 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PMS1-220	ENST00000618056	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	PHKG2	P15735	406 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.97
PMS1-220	ENST00000618056	LRP5	O75197	1615 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.96
PMS1-220	ENST00000618056	HMOX1	P09601	288 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	PIGB	Q92521	554 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PMS1-220	ENST00000618056	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	C5	P01031	1676 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	KCNQ4	P56696	695 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	RALBP1	Q15311	655 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PMS1-220	ENST00000618056	CABP4	P57796	275 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	SIK1	P57059	783 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	MRC1	P22897	1456 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PMS1-220	ENST00000618056	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.29	■■■□□ 2.92

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