RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617631.1

5S_rRNA.12-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TBX22Q9Y458 520 aa4.15□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.15□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MTA2O94776 668 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ABCD1P33897 745 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM29Q14134 588 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 UBE4AQ14139 1066 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NFE2L2Q16236 605 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MPNDQ8N594 471 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NGEFQ8N5V2 710 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C8orf48Q96LL4 319 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IWS1Q96ST2 819 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LNPKQ9C0E8 428 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PRDM2Q13029 1718 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VGLL3A8MV65 326 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SEMA3EO15041 775 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCP110O43303 1012 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HIP1RO75146 1068 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TPPPO94811 219 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TPM3P06753 285 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC175P0C221 793 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PSMA3P25788 255 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HSD3B2P26439 372 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF132P52740 706 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HSCBQ8IWL3 235 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IL17RAQ96F46 866 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHL1O00533 1208 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM37O94972 964 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LDHCP07864 332 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NAT1P18440 290 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF76P36508 570 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RASA3Q14644 834 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RGL3Q3MIN7 710 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NLRP13Q86W25 1043 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NDUFAF2Q8N183 169 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CDHR1Q96JP9 859 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MUC3BQ9H195 1237 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.12□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM25EA8MYX2 175 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM163BP0C2L3 166 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TGFB3P10600 412 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C16orf87Q6PH81 154 aa4.11□□□□□ -1.75
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 182.8 ms