RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ABCF2Q9UG63 623 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 CAGE1Q8TC20 777 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 AIDAQ96BJ3 306 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 AK7Q96M32 723 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM5Q9C035 493 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 AKNAQ7Z591 1439 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 NME9Q86XW9 330 aa23.89■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.89■■□□□ 1.42
CTDP1-208ENST00000613122 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.89■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 STIM1Q13586 685 aa23.89■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
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CTDP1-208ENST00000613122 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 RNF214Q8ND24 703 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 MYD88Q99836 296 aa23.88■■□□□ 1.41
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNF76P36508 570 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 KRT32Q14532 448 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 GRIN2AQ12879 1464 aa23.87■■□□□ 1.41
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CTDP1-208ENST00000613122 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 ME1P48163 572 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 DACH1Q9UI36 760 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 USP5P45974 858 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 MYO6Q9UM54 1294 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 TEX35Q5T0J7 233 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 TSPY26PQ9H489 355 aa23.84■■□□□ 1.41
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CTDP1-208ENST00000613122 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.83■■□□□ 1.41
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CTDP1-208ENST00000613122 DCTN1Q14203 1278 aa23.83■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 IDI1Q13907 227 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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CTDP1-208ENST00000613122 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 NAIPQ13075 1403 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 RAB11FIP3O75154 756 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 KRT85P78386 507 aa23.81■■□□□ 1.4
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CTDP1-208ENST00000613122 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 TRAK2O60296 914 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINC1P01008 464 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 CCP110O43303 1012 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 MRE11P49959 708 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 SLC5A1P13866 664 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 SLFN5Q08AF3 891 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.78■■□□□ 1.4
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