RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 IFT57Q9NWB7 429 aa18.39■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.38■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.38■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 PIP4K2BP78356 416 aa18.38■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 MEGF6O75095 1541 aa18.38■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF853P0CG23 659 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 CRB1P82279 1406 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 GNAI1P63096 354 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 DCTN1Q14203 1278 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 CERKQ8TCT0 537 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.36■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 MCM10Q7L590 875 aa18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
FCHO1-227ENST00000598960 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 CFAP44Q96MT7 982 aa18.33■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 MBIPQ9NS73 344 aa18.32■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 CACNA1FO60840 1977 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 CHL1O00533 1208 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 JCADQ9P266 1359 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 MRC1P22897 1456 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 IL17REQ8NFR9 667 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-227ENST00000598960 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 BCAR3O75815 825 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 STRN4Q9NRL3 753 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 PLIN1O60240 522 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 BTG4Q9NY30 223 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 EVA1CP58658 441 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF428Q96B54 188 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 SPG7Q9UQ90 795 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 DISP2A7MBM2 1401 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 SLIT2O94813 1529 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 VAMP4O75379 141 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 TSPYL6Q8N831 410 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-227ENST00000598960 LRP6O75581 1613 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 PAPPAQ13219 1627 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 ADAMTS2O95450 1211 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 IL2RBP14784 551 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 PHKG2P15735 406 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 LGR6Q9HBX8 967 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 KIF16BQ96L93 1317 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 ITGB4P16144 1822 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 C5P01031 1676 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 CYP27B1O15528 508 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 TEFQ10587 303 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 CRBNQ96SW2 442 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms