RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 KANK1Q14678 1352 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 C3P01024 1663 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE2BO14633 110 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 GLMNQ92990 594 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF428Q96B54 188 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 ERBINQ96RT1 1412 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-216ENST00000590105 COPS2P61201 443 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ROCK1Q13464 1354 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 MROH2AA6NES4 1674 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TNRQ92752 1358 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRL2O95490 1459 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZNB5 142 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 SLF2Q8IX21 1173 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PZPP20742 1482 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC27Q2M243 656 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 IDI1Q13907 227 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC3O15438 1527 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 NUP155O75694 1391 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ABL2P42684 1182 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPRTO14522 1441 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 POM121CA8CG34 1229 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 GJA5P36382 358 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SPTLC1O15269 473 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 GFRA3O60609 400 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM52Q96A61 297 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP1Q9C000 1473 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 RCCD1A6NED2 376 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ZPR1O75312 459 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJB2P25686 324 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 WASHC4Q2M389 1173 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 EID1Q9Y6B2 187 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVK-7P63135 1459 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TLL1O43897 1013 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC10A3P09131 477 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 STRCQ7RTU9 1775 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2R1Q13018 1463 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO41Q8TF61 875 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 DEPDC5O75140 1603 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 NAIPQ13075 1403 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 LTKP29376 864 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP152O94986 1710 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 NOS1P29475 1434 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-216ENST00000590105 LILRB3O75022 631 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms