RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXO3O43524 673 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 PIP4K2BP78356 416 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 NME9Q86XW9 330 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 FBLN1P23142 703 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 BRINP3Q76B58 766 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 CERKQ8TCT0 537 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 DCCP43146 1447 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 SLAIN2Q9P270 581 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 USP6P35125 1406 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF1AQ12756 1690 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC24A1O60721 1099 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC184Q52MB2 194 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3C2AO00443 1686 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 PSME1Q06323 249 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 SSH2Q76I76 1423 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 FYB1O15117 783 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNC4Q03721 635 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 PXDNQ92626 1479 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 ANP32CO43423 234 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 FOSBP53539 338 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 OXER1Q8TDS5 423 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-208ENST00000589162 MORC1Q86VD1 984 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ALS2Q96Q42 1657 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PHLPP1O60346 1717 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 DSG2Q14126 1118 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ABTB2Q8N961 1025 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 GFRA3O60609 400 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 TOM1O60784 492 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R1AP30153 589 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ILDR2Q71H61 639 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 COG3Q96JB2 828 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PEAK1Q9H792 1746 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R37O75864 691 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA3Q99758 1704 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 SBNO1A3KN83 1393 aa8.16□□□□□ -1.1
CAPNS1-208ENST00000589162 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms