RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.19■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 NHSQ6T4R5 1651 aa25.19■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 17.7
HDGFL2-201ENST00000587016 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 CFAP53Q96M91 514 aa25.17■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.15■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.15■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.14■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.14■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HDGFL2-201ENST00000587016 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.14■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM182BQ5T319 152 aa25.12■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.12■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.12■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.12■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.1■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC125Q86Z20 511 aa25.1■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 CYP27B1O15528 508 aa25.08■■□□□ 1.61
HDGFL2-201ENST00000587016 SPG7Q9UQ90 795 aa25.07■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 NUDCQ9Y266 331 aa25.07■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 BTAF1O14981 1849 aa25.06■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 ITGB4P16144 1822 aa25.06■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.05■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.05■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.05■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 HMOX1P09601 288 aa25.04■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 RREB1Q92766 1687 aa25.04■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 PHKG2P15735 406 aa25.02■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HDGFL2-201ENST00000587016 FCHSD2O94868 740 aa25.01■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 ANP32CO43423 234 aa25■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 TRIM37O94972 964 aa24.99■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 MRC1P22897 1456 aa24.98■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 LY75O60449 1722 aa24.98■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 PRKAR2BP31323 418 aa24.96■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.96■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.96■■□□□ 1.59
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.95■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.95■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.95■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 KCNQ2O43526 872 aa24.94■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.93■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 PLSCR1O15162 318 aa24.92■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.92■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 DCAF5Q96JK2 942 aa24.92■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.92■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 PAPPAQ13219 1627 aa24.92■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 BAG6P46379 1132 aa24.91■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC184Q52MB2 194 aa24.91■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.91■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.9■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 MAP3K5Q99683 1374 aa24.9■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.89■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.89■■□□□ 1.58
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.88■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 APBA3O96018 575 aa24.88■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.87■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.87■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.84■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.83■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HDGFL2-201ENST00000587016 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.82■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.82■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.82■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 PIGBQ92521 554 aa24.82■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 PROM2Q8N271 834 aa24.8■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 MRS2Q9HD23 443 aa24.8■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 NFE2L2Q16236 605 aa24.79■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 LGR6Q9HBX8 967 aa24.79■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.79■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 IL17REQ8NFR9 667 aa24.78■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 RUNDC1Q96C34 613 aa24.78■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.78■■□□□ 1.56
HDGFL2-201ENST00000587016 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms