RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583656.5

MTMR4-209, Transcript of myotubularin related protein 4, human

TSL 3

Gene MTMR4, Length 810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTMR4-209	ENST00000583656	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	MTHFS	P49914	203 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	KCNQ2	O43526	872 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MTMR4-209	ENST00000583656	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MTMR4-209	ENST00000583656	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MTMR4-209	ENST00000583656	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	IL13	P35225	146 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	PLSCR1	O15162	318 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	CYP27B1	O15528	508 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
MTMR4-209	ENST00000583656	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	PROM2	Q8N271	834 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTMR4-209	ENST00000583656	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	RREB1	Q92766	1687 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	HMOX1	P09601	288 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	PHKG2	P15735	406 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	BTAF1	O14981	1849 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MTMR4-209	ENST00000583656	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	KDR	P35968	1356 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MTMR4-209	ENST00000583656	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	PIGB	Q92521	554 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	KCNQ4	P56696	695 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.2	■■■□□ 2.75
MTMR4-209	ENST00000583656	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.19	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.19	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	RALBP1	Q15311	655 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.15	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	ITGB4	P16144	1822 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MTMR4-209	ENST00000583656	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	CABP4	P57796	275 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	LY75	O60449	1722 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MTMR4-209	ENST00000583656	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	FCHSD2	O94868	740 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	SIK1	P57059	783 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MTMR4-209	ENST00000583656	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
MTMR4-209	ENST00000583656	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MTMR4-209	ENST00000583656	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
MTMR4-209	ENST00000583656	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MTMR4-209	ENST00000583656	ATP6V1A	P38606	617 aa		31.98	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms