RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580633.5

TSPOAP1-AS1-207, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPOAP1-AS1, Length 842 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.11■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.11■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.09■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.69■■■□□ 2.18
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KCNQ4P56696 695 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZNF827Q17R98 1081 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 AKT1S1Q96B36 256 aa28.64■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.64■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 STK32BQ9NY57 414 aa28.63■■■□□ 2.17
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