RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572588.1

MKL2-206, Transcript of MKL/myocardin-like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene MKL2, Length 7,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		3.78	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GRM1	Q13255	1194 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	AGER	Q15109	404 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BRINP3	Q76B58	766 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SSH2	Q76I76	1423 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RTL1	A6NKG5	1358 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	KDM4A	O75164	1064 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GC	P02774	474 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PRKAR2B	P31323	418 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ATP7B	P35670	1465 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ANKRD62	A6NC57	917 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	LGR5	O75473	907 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	USP6	P35125	1406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	IL16	Q14005	1332 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	IL13	P35225	146 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GNAI1	P63096	354 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	WDR63	Q8IWG1	891 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	LMNB1	P20700	586 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GORAB	Q5T7V8	394 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	CLTCL1	P53675	1640 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	IQGAP1	P46940	1657 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	IP6K1	Q92551	441 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ABTB2	Q8N961	1025 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	CLGN	O14967	610 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGEF10	O15013	1369 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF592	Q92610	1267 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SEMA3E	O15041	775 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	MS4A1	P11836	297 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	GSE1	Q14687	1217 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	NFE2L2	Q16236	605 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TSPY2	A6NKD2	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TSPY3	P0CV98	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TSPY8	P0CW00	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TSPY1	Q01534	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	HOXC9	P31274	260 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	EYA1	Q99502	592 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BRD3	Q15059	726 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	MST1R	Q04912	1400 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SLFN5	Q08AF3	891 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PHF14	O94880	888 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	AP1G2	O75843	785 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	YY1	P25490	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	RIPK4	P57078	832 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	PRR29	P0C7W0	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MKL2-206	ENST00000572588	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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