RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 AMPHP49418 695 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 COL24A1Q17RW2 1714 aa23■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 IL2RBP14784 551 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF827Q17R98 1081 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 RTL1A6NKG5 1358 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 HOXC9P31274 260 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 GPR162Q16538 588 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 FBLN1P23142 703 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 KLHL34Q8N239 644 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 LY75O60449 1722 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS2-204ENST00000571386 FLT4P35916 1363 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 POLD1P28340 1107 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 AKT1S1Q96B36 256 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.86■■□□□ 1.25
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SPNS2-204ENST00000571386 INSRP06213 1382 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 IFFO2Q5TF58 517 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 PANK3Q9H999 370 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF4Q96M43 638 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 NSD2O96028 1365 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 KCNQ4P56696 695 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 MEGF6O75095 1541 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SPNS2-204ENST00000571386 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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SPNS2-204ENST00000571386 C5P01031 1676 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-204ENST00000571386 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
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SPNS2-204ENST00000571386 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-204ENST00000571386 POLKQ9UBT6 870 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS2-204ENST00000571386 GRIN3BO60391 1043 aa22.72■■□□□ 1.23
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SPNS2-204ENST00000571386 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-204ENST00000571386 ATP10DQ9P241 1426 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-204ENST00000571386 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-204ENST00000571386 MORC1Q86VD1 984 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 MSH5O43196 834 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 MSL1Q68DK7 614 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 NCAPD2Q15021 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-204ENST00000571386 EYA1Q99502 592 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS2-204ENST00000571386 SPG7Q9UQ90 795 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS2-204ENST00000571386 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.64■■□□□ 1.21
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SPNS2-204ENST00000571386 C4BP0C0L5 1744 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS2-204ENST00000571386 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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SPNS2-204ENST00000571386 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
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SPNS2-204ENST00000571386 CYP27B1O15528 508 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA6P17066 643 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 PALLDQ8WX93 1383 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS2-204ENST00000571386 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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