RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 MEGF6O75095 1541 aa22.99■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 IFT57Q9NWB7 429 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 ZNF853P0CG23 659 aa22.97■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.97■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 CRB1P82279 1406 aa22.97■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 GNAI1P63096 354 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC2-208ENST00000566635 MBIPQ9NS73 344 aa22.95■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 PLIN1O60240 522 aa22.94■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 CFAP44Q96MT7 982 aa22.94■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 STRN4Q9NRL3 753 aa22.94■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 BCAR3O75815 825 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 BTG4Q9NY30 223 aa22.92■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.91■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 IL17REQ8NFR9 667 aa22.91■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTS2O95450 1211 aa22.9■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HERC2-208ENST00000566635 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 EVA1CP58658 441 aa22.89■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.89■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 CHL1O00533 1208 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 NRAPQ86VF7 1730 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 LGR6Q9HBX8 967 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 TSPYL6Q8N831 410 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 JCADQ9P266 1359 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 KRT24Q2M2I5 525 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 USP35Q9P2H5 1018 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 SPG7Q9UQ90 795 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC2-208ENST00000566635 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 VAMP4O75379 141 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 PHKG2P15735 406 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 IL2RBP14784 551 aa22.8■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.8■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.8■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 CYP27B1O15528 508 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 HSPA1LP34931 641 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 LRP6O75581 1613 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 CRBNQ96SW2 442 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 SLIT2O94813 1529 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC2-208ENST00000566635 TEFQ10587 303 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 TNNQ9UQP3 1299 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 DISP2A7MBM2 1401 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 ZNF428Q96B54 188 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 MRC1P22897 1456 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 C8orf37Q96NL8 207 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 BTBD11A6QL63 1104 aa22.72■■□□□ 1.23
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