RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-218	ENST00000566180	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
RNPS1-218	ENST00000566180	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
RNPS1-218	ENST00000566180	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RNPS1-218	ENST00000566180	SBF2	Q86WG5	1849 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RNPS1-218	ENST00000566180	PROM2	Q8N271	834 aa		29.13	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.12	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	RREB1	Q92766	1687 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNPS1-218	ENST00000566180	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	CYP27B1	O15528	508 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RNPS1-218	ENST00000566180	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNPS1-218	ENST00000566180	MTHFS	P49914	203 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNPS1-218	ENST00000566180	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
RNPS1-218	ENST00000566180	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNPS1-218	ENST00000566180	IL13	P35225	146 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNPS1-218	ENST00000566180	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
RNPS1-218	ENST00000566180	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	BTAF1	O14981	1849 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	PHKG2	P15735	406 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	KDR	P35968	1356 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RNPS1-218	ENST00000566180	LRP5	O75197	1615 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	PIGB	Q92521	554 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	KCNQ4	P56696	695 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-218	ENST00000566180	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	HMOX1	P09601	288 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RNPS1-218	ENST00000566180	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	LY75	O60449	1722 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.72	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RNPS1-218	ENST00000566180	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	SIK1	P57059	783 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	CABP4	P57796	275 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	ITGB4	P16144	1822 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	PTGER2	P43116	358 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.64	■■■□□ 2.18
RNPS1-218	ENST00000566180	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RNPS1-218	ENST00000566180	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RNPS1-218	ENST00000566180	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RNPS1-218	ENST00000566180	ITPK1	Q13572	414 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RNPS1-218	ENST00000566180	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17

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