RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		22.87	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	KIF2C	Q99661	725 aa		22.87	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	CRB1	P82279	1406 aa		22.86	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	ATP10D	Q9P241	1426 aa		22.86	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	TRAK2	O60296	914 aa		22.85	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	22.85	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	SBNO1	A3KN83	1393 aa		22.84	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	FLT4	P35916	1363 aa		22.84	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	TTC22	Q5TAA0	569 aa		22.84	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	CEP85	Q6P2H3	762 aa		22.84	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM2F	A1L443	756 aa		22.83	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		22.83	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	22.83	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	22.83	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	PTMS	P20962	102 aa		22.83	■■□□□ 1.25
RRN3-205	ENST00000563559	RTL1	A6NKG5	1358 aa		22.83	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRU	Q92729	1446 aa		22.83	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	22.82	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	KRT24	Q2M2I5	525 aa		22.82	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	GBP4	Q96PP9	640 aa		22.82	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	KDR	P35968	1356 aa		22.82	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	TBX22	Q9Y458	520 aa		22.82	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		22.82	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	HMMR	O75330	724 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A2	P04920	1241 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	MSH6	P52701	1360 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	FSD2	A1L4K1	749 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		22.81	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	CASC1	Q6TDU7	716 aa		22.8	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		22.8	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLIT1	O75093	1534 aa		22.8	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		22.79	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		22.79	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		22.78	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	RABEP1	Q15276	862 aa		22.78	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	22.78	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	22.78	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	22.78	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		22.77	■■□□□ 1.24
RRN3-205	ENST00000563559	SOX12	O15370	315 aa		22.76	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	AMPH	P49418	695 aa		22.76	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	22.76	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	MEIS3	Q99687	375 aa		22.76	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	DIP2A	Q14689	1571 aa		22.76	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	22.75	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	STK31	Q9BXU1	1019 aa		22.74	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	22.74	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	22.73	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	EYA1	Q99502	592 aa		22.73	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	USP26	Q9BXU7	913 aa		22.73	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	FOXO3	O43524	673 aa		22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	MRE11	P49959	708 aa		22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	SDS	P20132	328 aa		22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		22.72	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	REC8	O95072	547 aa		22.71	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		22.7	■■□□□ 1.23
RRN3-205	ENST00000563559	GNAI2	P04899	355 aa		22.7	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	22.7	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		22.7	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3C2A	O00443	1686 aa		22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		22.69	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	22.68	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP6	P59044	892 aa		22.68	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	G2E3	Q7L622	706 aa		22.68	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	GNAI3	P08754	354 aa		22.67	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC37A3	O60309	1634 aa		22.67	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1F	O60840	1977 aa		22.67	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	APBB1	O00213	710 aa		22.66	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	ST18	O60284	1047 aa		22.66	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559		F6X3S4	739 aa		22.65	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	ERC2	O15083	957 aa		22.65	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC9	P31274	260 aa		22.64	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	NUCB2	P80303	420 aa		22.64	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	FLII	Q13045	1269 aa		22.64	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		22.64	■■□□□ 1.22
RRN3-205	ENST00000563559	USP54	Q70EL1	1684 aa		22.64	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	PDE1A	P54750	535 aa		22.64	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	22.64	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K5	Q99683	1374 aa		22.63	■■□□□ 1.21
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	22.63	■■□□□ 1.21

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