RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.45■■□□□ 1.67
RABGGTA-208ENST00000558954 CFAP53Q96M91 514 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL9O00512 1426 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 IL13P35225 146 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 RALBP1Q15311 655 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC125Q86Z20 511 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 KDRP35968 1356 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 BTAF1O14981 1849 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-208ENST00000558954 ITGB4P16144 1822 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM37O94972 964 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.652e-8■□□□□ 10.7
RABGGTA-208ENST00000558954 SPG7Q9UQ90 795 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-208ENST00000558954 RREB1Q92766 1687 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 NUDCQ9Y266 331 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 HMOX1P09601 288 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 BAG6P46379 1132 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP27B1O15528 508 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-208ENST00000558954 APBA3O96018 575 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 LY75O60449 1722 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 PHKG2P15735 406 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNQ2O43526 872 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-208ENST00000558954 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 ANP32CO43423 234 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKAR2BP31323 418 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 FCHSD2O94868 740 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 PLSCR1O15162 318 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF5Q96JK2 942 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-208ENST00000558954 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 MRC1P22897 1456 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K5Q99683 1374 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 NEFMP07197 916 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 C5P01031 1676 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 PAPPAQ13219 1627 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 TXNRD1Q16881 649 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 PIGBQ92521 554 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 PALLDQ8WX93 1383 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 CABP4P57796 275 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 PROM2Q8N271 834 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-208ENST00000558954 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-208ENST00000558954 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25■■□□□ 1.59
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