RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 DDIT3P35638 169 aa22.06■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 PANK2Q9BZ23 570 aa22.06■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 DCTPP1Q9H773 170 aa22.06■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 SNX21Q969T3 373 aa22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 USP6P35125 1406 aa22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 SLC4A2P04920 1241 aa22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 PTPRUQ92729 1446 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 ATP10DQ9P241 1426 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 CDC45O75419 566 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 CEP85Q6P2H3 762 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.02■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 NECTIN2Q92692 538 aa22.02■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.02■■□□□ 1.12
XRCC3-218ENST00000557439 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.01■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 TTC22Q5TAA0 569 aa22.01■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 RTL1A6NKG5 1358 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 CRB1P82279 1406 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 EYA1Q99502 592 aa21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 AK9Q5TCS8 1911 aa21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 SDSP20132 328 aa21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 FSD2A1L4K1 749 aa21.96■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 SSFA2P28290 1259 aa21.96■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 AMPHP49418 695 aa21.96■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
XRCC3-218ENST00000557439 USP31Q70CQ4 1352 aa21.95■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.95■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.95■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.95■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 KIAA0232Q92628 1395 aa21.95■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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XRCC3-218ENST00000557439 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.94■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.94■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 SSH2Q76I76 1423 aa21.93■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.93■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 PTPRCP08575 1304 aa21.93■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.93■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 NLRP6P59044 892 aa21.92■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 USP26Q9BXU7 913 aa21.92■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.91■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 EID1Q9Y6B2 187 aa21.91■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 FLT4P35916 1363 aa21.9■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.9■■□□□ 1.1
XRCC3-218ENST00000557439 ARHGEF10O15013 1369 aa21.9■■□□□ 1.1
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XRCC3-218ENST00000557439 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.89■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 SBNO1A3KN83 1393 aa21.88■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 PKP1Q13835 747 aa21.88■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 GBP4Q96PP9 640 aa21.88■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.87■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 PLEKHG5O94827 1062 aa21.87■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 C14orf37Q86TY3 774 aa21.87■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.86■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.86■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.86■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.85■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 FLIIQ13045 1269 aa21.85■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 RABEP1Q15276 862 aa21.85■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 KDRP35968 1356 aa21.85■■□□□ 1.09
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XRCC3-218ENST00000557439 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 STK31Q9BXU1 1019 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 PIK3C2AO00443 1686 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 DIP2AQ14689 1571 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 PDE1AP54750 535 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 IL17REQ8NFR9 667 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 KCNA6P17658 529 aa21.83■■□□□ 1.09
XRCC3-218ENST00000557439 HOXC9P31274 260 aa21.83■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 HMMRO75330 724 aa21.82■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 GNAI2P04899 355 aa21.82■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.81■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.81■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 ABTB2Q8N961 1025 aa21.81■■□□□ 1.08
XRCC3-218ENST00000557439 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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