RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557119.2

PITX2-209, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PITX2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-209ENST00000557119 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 NUTM2FA1L443 756 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 RGS12O14924 1447 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 LNPKQ9C0E8 428 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX2-209ENST00000557119 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 MCM10Q7L590 875 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 STRCQ7RTU9 1775 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 AMPHP49418 695 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 EYA1Q99502 592 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 DCTPP1Q9H773 170 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 LRRC37A3O60309 1634 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 KCNA6P17658 529 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX2-209ENST00000557119 GSE1Q14687 1217 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 RTL1A6NKG5 1358 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 NLRP6P59044 892 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 ATP10DQ9P241 1426 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 NWD1Q149M9 1564 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 CACNA1FO60840 1977 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 HOXC9P31274 260 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 SNX21Q969T3 373 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 KRT24Q2M2I5 525 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX2-209ENST00000557119 SOX12O15370 315 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 FOXO3O43524 673 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 SLC4A2P04920 1241 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 CEP85Q6P2H3 762 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 ABTB2Q8N961 1025 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 MSH6P52701 1360 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX2-209ENST00000557119 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 MAP3K5Q99683 1374 aa28■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 CDC45O75419 566 aa28■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 HSCBQ8IWL3 235 aa28■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 HMMRO75330 724 aa27.98■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.98■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 NFAT5O94916 1531 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 IP6K1Q92551 441 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 STK31Q9BXU1 1019 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 LTN1O94822 1766 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 TTC22Q5TAA0 569 aa27.95■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 MEIS3Q99687 375 aa27.95■■■□□ 2.07
PITX2-209ENST00000557119 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 IL17REQ8NFR9 667 aa27.93■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 KIF2CQ99661 725 aa27.93■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.93■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.93■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 DDIT3P35638 169 aa27.92■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 G2E3Q7L622 706 aa27.92■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.91■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.91■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.9■■■□□ 2.06
PITX2-209ENST00000557119 GNAI3P08754 354 aa27.89■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 FLIIQ13045 1269 aa27.89■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 GNAI2P04899 355 aa27.88■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.87■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 HOXB7P09629 217 aa27.87■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 NCAPD2Q15021 1401 aa27.86■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 MCM4P33991 863 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 SLIT3O75094 1523 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 F6X3S4 739 aa27.83■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.83■■■□□ 2.05
PITX2-209ENST00000557119 PSME1Q06323 249 aa27.83■■■□□ 2.04
PITX2-209ENST00000557119 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms