RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556726.5

CCDC88C-211, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC88C, Length 3,617 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88C-211ENST00000556726 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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CCDC88C-211ENST00000556726 KDM4AO75164 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 GPATCH3Q96I76 525 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 PTPRCP08575 1304 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 AACSQ86V21 672 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 ZFYVE9O95405 1425 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 KCNA6P17658 529 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 LGR6Q9HBX8 967 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC88C-211ENST00000556726 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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